ด้วยศาสตราจารย์ ดร.สุชาติ อุปถัมภ์ (อธิการบดี มหาวิทยาลัยบูรพา) มีความคิดริเริ่ม ที่จะให้มหาวิทยาลัยบูรพามีคณะเภสัชศาสตร์เพื่อเสริม สร้างความเข้มแข็งให้กับกลุ่มคณะทางด้านวิทยาศาสตร์สุขภาพของมหาวิทยาลัยบูรพา โดยมีการแต่งตั้งคณะกรรมการโครงการจัดตั้งคณะเภสัชศาสตร์ และร่างหลักสูตร เภสัชศาสตร์บัณฑิตขึ้นในวันที่ ๒๔ มิถุนานยน ๒๕๕๒ ซึ่งมีรองศาสตราจารย์ ดร. มณฑล สงวนเสริมศรี (อดีต คณบดีคณะเภสัชศาสตร์ และอธิการบดีมหาวิทยาลัยนเรศวร) เป็นประธานกรรมการและรองศาสตราจารย์ ดร.เรณา พงษ์เรืองพันธุ์ (รองอธิการบดีฝ่ายวิชาการ มหาวิทยาลัยบูรพา) เป็นรองประธานกรรมการ พร้อมด้วยคณาจารย์จากคณะเภสัชศาสตร์ มหาวิทยาลัยนเรศวร และบุคลากรของมหาวิทยาลัย บูรพาเป็นกรรมการ จากนั้น สภามหาวิทยาลัยบูรพาได้อนุมัติการจัดตั้งคณะเภสัชศาสตร์เมื่อวันที่ ๒๕ กันยายน ๒๕๕๒ และ ประกาศในราชกิจจานุเบกษาเมื่อวันที่ ๒๖ ตุลาคม ๒๕๕๒
