จิตรกรรมฝาผนังภายในพระอุโบสถของวัดใหญ่อินทารามนี้ เป็นภาพจิตรกรรมสีฝุ่นที่มีความงดงามและสมบูรณ์ตามลักษณะของจิตรกรรมฝาผนังแบบไทยประเพณี ร่องรอยต่างๆ ที่ปรากฎบนภาพจิตรกรรม  แสดงให้เห็นว่าได้มีการซ่อมเพิ่มเติมในหลายครั้ง จึงมีเทคนิคและรูปแบบที่แตกต่างกันหลายอย่าง บางแห่งยังคงมีเค้าคติแบบจิตรกรรมอยุธยาและรัตนโกสินทร์ตอนต้น ภาพที่เหลือส่วนใหญ่เป็นจิตรกรรมสมัยรัชกาลที่ ๓-๔ สำหรับผนังด้านใต้มีบางห้องที่แสดงถึงศิลปะแบบตะวันตกอย่างชัดเจน เป็นภาพที่เขียนขึ้นพร้อมการซ่อมในปี พ.ศ. ๒๔๕๗  บนผนังระหว่างช่องหน้าต่างทั้งสองข้าง เขียนเรื่องทศชาติชาดก ตอนบนเป็นภาพเทพชุมนุมเรียงกันสามชั้น ผนังด้านหน้าตรงข้ามพระประธานเป็นภาพมารผจญ มีภาพทหารชาติต่างๆ ถืออาวุธต่างชนิดกัน ผนังด้านหลังพระประธานเป็นเรื่องไตรภูมิมีแผนภูมิจักรวาล ป่าหิมพานต์ นรกภูมิ และพุทธประวัติ บนเพดานเขียนเป็นลายดาวเพดานบนพื้นสีแดง ส่วนขื่อเขียนเป็นลายไทยคล้ายลายผ้าโบราณ
เสาหกคู่ที่รองรับขื่อเขียนลายทองทุกต้นทางวัดได้ร่วมกับกรมศิลปากรดูแลรักษาจิตรกรรมภายในพระอุโบสถไว้ในสภาพที่สมบูรณ์ และพร้อมคำบรรยายประกอบจิตรกรรมแต่ละด้านไว้ จึงนับได้ว่าทรงคุณค่าทั้งในด้านความงาม และคุณค่าในด้านการศึกษาเปรียบเทียบถึงวิวัฒนาการของจิตรกรรมฝาผนังในแต่ละช่วงเวลาได้อย่างดี